La Copa de la UEFA 1988-89 se disputó entre septiembre de 1988 y mayo de 1989, con la participación total de 64 equipos representantes de 31 federaciones nacionales afiliadas a la UEFA.
La final, disputada a doble partido el 3 y el 17 de mayo de 1989 enfrentó al Napoli y al VfB Stuttgart, con victoria del equipo italiano por un marcador global de 5-4, siendo este el único título europeo a nivel internacional en la carrera del futbolista argentino Diego Maradona.
Fue la cuarta edición de la Copa de la UEFA sin la participación de los equipos ingleses por la Tragedia de Heysel.
Treintaidosavos de final
Dieciseisavos de final
Rondas finales
Final
Ida
Vuelta
Máximos goleadores
Los máximos goleadores de la Copa de la UEFA 1988-89 fueron:
